MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 chromosome circular

Total Repeats: 63175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63001	NC_003062	ACC	2	6	2832161	2832166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15890072
63002	NC_003062	CAT	2	6	2832227	2832232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890072
63003	NC_003062	CTT	2	6	2832252	2832257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63004	NC_003062	TTG	2	6	2832272	2832277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63005	NC_003062	TA	3	6	2832299	2832304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63006	NC_003062	GGA	2	6	2832345	2832350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63007	NC_003062	CGCAG	2	10	2832420	2832429	20 %	0 %	40 %	40 %	159185403
63008	NC_003062	GAA	2	6	2832448	2832453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159185403
63009	NC_003062	GCA	2	6	2832462	2832467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185403
63010	NC_003062	GCC	2	6	2832483	2832488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185403
63011	NC_003062	CGG	2	6	2832504	2832509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185403
63012	NC_003062	CGTT	2	8	2832519	2832526	0 %	50 %	25 %	25 %	159185403
63013	NC_003062	ATT	2	6	2832628	2832633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159185404
63014	NC_003062	CAG	2	6	2832641	2832646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185404
63015	NC_003062	CGTG	2	8	2832884	2832891	0 %	25 %	50 %	25 %	159185404
63016	NC_003062	GC	5	10	2832922	2832931	0 %	0 %	50 %	50 %	159185404
63017	NC_003062	CGG	2	6	2832937	2832942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185404
63018	NC_003062	CCGGA	2	10	2832968	2832977	20 %	0 %	40 %	40 %	159185404
63019	NC_003062	GAT	2	6	2833031	2833036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159185404
63020	NC_003062	CGA	2	6	2833135	2833140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185404
63021	NC_003062	ATC	2	6	2833163	2833168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159185404
63022	NC_003062	CCAG	2	8	2833203	2833210	25 %	0 %	25 %	50 %	159185404
63023	NC_003062	CG	3	6	2833217	2833222	0 %	0 %	50 %	50 %	159185404
63024	NC_003062	GCG	2	6	2833226	2833231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185404
63025	NC_003062	ACT	3	9	2833275	2833283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159185404
63026	NC_003062	GGC	2	6	2833313	2833318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185404
63027	NC_003062	CG	3	6	2833412	2833417	0 %	0 %	50 %	50 %	159185404
63028	NC_003062	CAAT	2	8	2833456	2833463	50 %	25 %	0 %	25 %	159185404
63029	NC_003062	ATC	2	6	2833499	2833504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159185404
63030	NC_003062	GGC	2	6	2833543	2833548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890074
63031	NC_003062	CT	4	8	2833561	2833568	0 %	50 %	0 %	50 %	15890074
63032	NC_003062	CTG	2	6	2833735	2833740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890074
63033	NC_003062	CAG	2	6	2833834	2833839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890074
63034	NC_003062	CTGA	2	8	2833840	2833847	25 %	25 %	25 %	25 %	15890074
63035	NC_003062	GGGC	2	8	2833936	2833943	0 %	0 %	75 %	25 %	15890074
63036	NC_003062	CGCA	2	8	2833993	2834000	25 %	0 %	25 %	50 %	15890074
63037	NC_003062	CCG	2	6	2834088	2834093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890074
63038	NC_003062	AGA	2	6	2834132	2834137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15890074
63039	NC_003062	GAT	2	6	2834212	2834217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15890074
63040	NC_003062	GTT	2	6	2834267	2834272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15890074
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63042	NC_003062	T	7	7	2834318	2834324	0 %	100 %	0 %	0 %	15890074
63043	NC_003062	AAC	2	6	2834387	2834392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15890075
63044	NC_003062	TTA	2	6	2834484	2834489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15890075
63045	NC_003062	ATT	2	6	2834510	2834515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15890075
63046	NC_003062	GTT	2	6	2834589	2834594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15890075
63047	NC_003062	TTA	2	6	2834685	2834690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15890075
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63049	NC_003062	TGA	2	6	2834746	2834751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15890075
63050	NC_003062	CCG	3	9	2834763	2834771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890075
63051	NC_003062	T	7	7	2834789	2834795	0 %	100 %	0 %	0 %	15890075
63052	NC_003062	GAG	2	6	2834800	2834805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15890075
63053	NC_003062	GC	3	6	2834821	2834826	0 %	0 %	50 %	50 %	15890075
63054	NC_003062	CTT	2	6	2834897	2834902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15890075
63055	NC_003062	AGC	3	9	2835041	2835049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890076
63056	NC_003062	CGGG	2	8	2835103	2835110	0 %	0 %	75 %	25 %	15890076
63057	NC_003062	AAATCG	2	12	2835161	2835172	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15890076
63058	NC_003062	AGC	2	6	2835347	2835352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890076
63059	NC_003062	ACG	2	6	2835364	2835369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890076
63060	NC_003062	TCA	2	6	2835435	2835440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890076
63061	NC_003062	AAG	2	6	2835467	2835472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15890076
63062	NC_003062	GCT	2	6	2835483	2835488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890076
63063	NC_003062	GTC	2	6	2835628	2835633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890076
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63067	NC_003062	ATC	2	6	2835964	2835969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890076
63068	NC_003062	TGG	2	6	2835995	2836000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15890076
63069	NC_003062	AG	3	6	2836090	2836095	50 %	0 %	50 %	0 %	15890076
63070	NC_003062	GAT	2	6	2836111	2836116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15890076
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63072	NC_003062	TCA	2	6	2836208	2836213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890076
63073	NC_003062	CTGC	2	8	2836215	2836222	0 %	25 %	25 %	50 %	15890076
63074	NC_003062	TCCA	2	8	2836252	2836259	25 %	25 %	0 %	50 %	15890076
63075	NC_003062	GA	3	6	2836330	2836335	50 %	0 %	50 %	0 %	15890076
63076	NC_003062	CGGC	2	8	2836352	2836359	0 %	0 %	50 %	50 %	15890076
63077	NC_003062	CATCG	2	10	2836528	2836537	20 %	20 %	20 %	40 %	15890076
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63079	NC_003062	TGCG	2	8	2836580	2836587	0 %	25 %	50 %	25 %	15890076
63080	NC_003062	GAATT	2	10	2836630	2836639	40 %	40 %	20 %	0 %	15890076
63081	NC_003062	GCA	2	6	2836643	2836648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890076
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63083	NC_003062	GCC	2	6	2836802	2836807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890076
63084	NC_003062	ACC	3	9	2836828	2836836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15890076
63085	NC_003062	AAC	2	6	2836840	2836845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15890076
63086	NC_003062	TGC	2	6	2836869	2836874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63087	NC_003062	GCG	2	6	2837014	2837019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890077
63088	NC_003062	T	6	6	2837106	2837111	0 %	100 %	0 %	0 %	15890077
63089	NC_003062	ACGGGC	2	12	2837115	2837126	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15890077
63090	NC_003062	TC	3	6	2837165	2837170	0 %	50 %	0 %	50 %	15890077
63091	NC_003062	CTT	2	6	2837207	2837212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15890077
63092	NC_003062	GA	3	6	2837224	2837229	50 %	0 %	50 %	0 %	15890077
63093	NC_003062	ATC	2	6	2837235	2837240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890077
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63102	NC_003062	TCG	2	6	2837716	2837721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890077
63103	NC_003062	GC	3	6	2837747	2837752	0 %	0 %	50 %	50 %	15890077
63104	NC_003062	CAT	2	6	2837780	2837785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890077
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63108	NC_003062	TCC	2	6	2837946	2837951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15890077
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63115	NC_003062	TCT	2	6	2838466	2838471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15890078
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.